Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Itgb6Q9Z0T9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms