Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChrdQ9Z0E2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ChrdQ9Z0E2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms