Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL6

Extl3, Exostosin-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl3Q9WVL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Extl3Q9WVL6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Extl3Q9WVL6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Extl3Q9WVL6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Extl3Q9WVL6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Extl3Q9WVL6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms