Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Opn3Q9WUK7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn3Q9WUK7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms