Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcsQ9WU84 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcsQ9WU84 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms