Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrf1Q9WU00 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nrf1Q9WU00 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms