Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ggps1Q9WTN0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggps1Q9WTN0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms