Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TapbpQ9R233 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TapbpQ9R233 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms