Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc6Q9R1S7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc6Q9R1S7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abcc6Q9R1S7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms