Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubd1Q9R1K7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubd1Q9R1K7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubd1Q9R1K7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms