Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Wdr54Q9R0D8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Wdr54Q9R0D8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms