Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nek3Q9R0A5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nek3Q9R0A5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nek3Q9R0A5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms