Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rnf4Q9QZS2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rnf4Q9QZS2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf4Q9QZS2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf4Q9QZS2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf4Q9QZS2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf4Q9QZS2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rnf4Q9QZS2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms