Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Col4a3Q9QZS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Col4a3Q9QZS0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Col4a3Q9QZS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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