Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Copg1Q9QZE5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Copg1Q9QZE5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms