Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClnkQ9QZE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ClnkQ9QZE2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms