Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn8Q9QZ49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms