Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vnn3Q9QZ25 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vnn3Q9QZ25 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms