Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phtf1Q9QZ09 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Phtf1Q9QZ09 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Phtf1Q9QZ09 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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