Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hacd1Q9QY80 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hacd1Q9QY80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms