Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VapbQ9QY76 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VapbQ9QY76 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VapbQ9QY76 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms