Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pkp3Q9QY23 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pkp3Q9QY23 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pkp3Q9QY23 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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