Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nr2e3Q9QXZ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms