Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnip3Q9QXT8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnip3Q9QXT8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms