Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trip4Q9QXN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trip4Q9QXN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip4Q9QXN3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms