Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NmuQ9QXK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NmuQ9QXK8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NmuQ9QXK8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms