Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rad18Q9QXK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad18Q9QXK2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms