Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trp53inp1Q9QXE4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trp53inp1Q9QXE4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trp53inp1Q9QXE4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms