Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Limd1Q9QXD8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Limd1Q9QXD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Limd1Q9QXD8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms