Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWI6

Srcin1, SRC kinase signaling inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srcin1Q9QWI6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srcin1Q9QWI6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Srcin1Q9QWI6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srcin1Q9QWI6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms