Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc2lQ9JME7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms