Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Crlf1Q9JM58 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Crlf1Q9JM58 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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