Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rabgef1Q9JM13 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Rabgef1Q9JM13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rabgef1Q9JM13 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rabgef1Q9JM13 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms