Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cabp1Q9JLK7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cabp1Q9JLK7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cabp1Q9JLK7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms