Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cabp2Q9JLK4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cabp2Q9JLK4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms