Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cabp5Q9JLK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cabp5Q9JLK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp5Q9JLK3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cabp5Q9JLK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms