Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkd2l2Q9JLG4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms