Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tlr5Q9JLF7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tlr5Q9JLF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlr5Q9JLF7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms