Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Arl6ip1Q9JKW0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arl6ip1Q9JKW0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms