Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ldb3Q9JKS4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ldb3Q9JKS4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ldb3Q9JKS4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms