Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms