Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trem1Q9JKE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trem1Q9JKE2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms