Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scamp5Q9JKD3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scamp5Q9JKD3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scamp5Q9JKD3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms