Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smpd3Q9JJY3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd3Q9JJY3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd3Q9JJY3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms