Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ercc6l2Q9JIM3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ercc6l2Q9JIM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms