Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prmt1Q9JIF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prmt1Q9JIF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms