Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pus3Q9JI38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pus3Q9JI38 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pus3Q9JI38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms