Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tcirg1Q9JHF5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tcirg1Q9JHF5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms