Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zcchc17Q9ESX4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc17Q9ESX4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc17Q9ESX4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms