Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim2Q9ESN6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim2Q9ESN6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms